遥远的未来，人类不再生活在行星上，各国建造了超巨型载人飞船组成联邦舰队遨游宇宙。 一个偶然的机会，人类联邦发现了“母体”，并以此研发出了具有生命形态的机甲芯片，移植到人类脑中后能使其成为与超人类同一等阶的最强单兵作战武器——机甲战士。 宇宙之中数个同样拥有高度文明的种族与人类联邦发生首次战争时，神秘的星际法则随即出现，规定各族之间每隔两千年才能进行一次大战，任何违逆法则的个人或舰队都会被立刻清除。 故事，就是从一个有着机甲战士体质的学生开始的。